Практически никакой сайт не сможет оставаться без ошибок в яндексе, так как вычисляет их робот и это нормально. По первому пункту, просмотрите какие это страницы, возможно действительно они должны быть запрещены. По второму, не все форматы яндекс поддерживает, так же надо смотреть что за страницы. Не надо на этом зацикливаться, 6 страниц это не так много, тем более если ошибки такого плана.